bash — командная оболочка

Различай ключи запуска bash, параметры set и параметры shopt: это разные интерфейсы, а не один плоский список ключей. bash script.sh запускает сценарий в другой оболочке. source script.sh выполняет его в текущей и может изменить её переменные и каталог.

Для просмотра параметров оболочки используй set -o, для дополнительных переключателей — shopt. Это диагностические вызовы без изменения режима. Не переноси настройки из чужого примера, пока не выяснишь, к какой оболочке они должны применяться.